不同生态环境下水稻穗部性状QTL鉴定

doi:10.16819/j.1001-7216.2019.8100

中国水稻科学 ›› 2019, Vol. 33 ›› Issue (2): 124-134.DOI: 10.16819/j.1001-7216.2019.8100

不同生态环境下水稻穗部性状QTL鉴定

刘进^1,²^,^#, 姚晓云^1,²^,^#, 刘丹³, 余丽琴¹, 李慧¹, 王棋², 王嘉宇^2,^*(), 黎毛毛^1,^*()

¹江西省农业科学院水稻研究所/水稻国家工程实验室(南昌)/国家水稻改良中心南昌分中心, 南昌 330200
²沈阳农业大学水稻研究所, 沈阳 110866
³黑龙江省农业科学院牡丹江分院, 黑龙江牡丹江 157041

收稿日期:2018-09-03 修回日期:2018-11-19 出版日期:2019-03-10 发布日期:2019-03-10
通讯作者: 王嘉宇,黎毛毛
作者简介:^＃共同第一作者;
基金资助:
国家重点研发计划资助项目(2016YFD0100101-11);江西省青年科学基金资助项目(20171BAB214026);江西现代农业科研协同创新专项(JXXTCX201701-01);江西省农业科学院博士启动基金资助项目(20162CBS007)

Identification of QTL for Panicle Traits under Multiple Environments in Rice(Oryza sativa L.)

Jin LIU^1,²^,^#, Xiaoyun YAO^1,²^,^#, Dan LIU³, Liqin YU¹, Hui LI¹, Qi WANG², Jiayu WANG^2,^*(), Maomao LI^1,^*()

¹Rice Research Institute, Jiangxi Academy of Agricultural Sciences/National Engineering Laboratory for Rice(Nanchang)/National Rice Improvement Center(Nanchang Sub-center), Nanchang 330200, China
²Rice Research Institute, Shenyang Agricultural University, Shenyang Liaoning 110866, China
³Mudanjiang Branch of Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Mudanjiang 157041, China

Received:2018-09-03 Revised:2018-11-19 Online:2019-03-10 Published:2019-03-10
Contact: Jiayu WANG, Maomao LI
About author:^#These authors contributed equally to this work;

摘要/Abstract

摘要：

【目的】发掘与产量相关的穗粒性状QTL对进一步克隆和利用高产基因具有重要意义。【方法】以超级粳稻龙稻5号和典型高产籼稻中优早8号杂交衍生的重组自交系群体为试材,在4种环境下对穗部性状进行比较和QTL分析。【结果】共检测到63个穗部性状QTL,分布于除第9染色体外的11条染色体上。在4个环境下分别检测到27、27、18和35个QTL。其中,16个QTL能在2个环境下被检测到,12个在3个以上环境下稳定表达,分别占QTL总数的25.40%和19.05%;第1、3、4和5染色体的多效QTL簇能在不同环境下稳定表达,对穗部性状具有明显的调控作用。【结论】第3染色体STS3.3-STS3.6区间的qSNP3、第4染色体RM5688-RM1359区间的qSNP4.1是2个新的稳定表达的多效性QTL簇。此外,上位性效应是调控穗部性状的重要组分。

关键词: 水稻, 生态环境, 穗部性状, 上位性效应

Abstract:

【Objective】It is important to explore new panicle and grain traits QTL related to yield for further cloning and utilization of high yield genes. 【Method】A recombinant inbred line (RIL) population derived from the cross between Longdao 5 (super high-yielding japonica) and Zhongyouzao 8 (typical indica) was used to identify QTL for panicle traits in multiple environments.【Result】Sixty-three QTLs were detected on chromosomes 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10 and 12. Among them, 27, 27, 18 and 35 QTLs were detected in four ecological environments, respectively. Among these QTLs, 16 QTLs were detected in two environments, 12 QTLs were detected in more than three environments, namely 25.40% and 19.05% were stably and reliably detected across multi-environments. The QTLs with pleiotropic genetic overlap effect clustered on chromosomes 1, 3, 4 and 5 were detected in multi-environments, indicating they have significant effects on panicle traits. 【Conclusion】 qSNP3 (STS3.3-STS3.6) on chromosome 3 and qSNP4.1 (RM5688-RM1359) on chromosome 4 may be two novel pleiotropic QTL clusters controlling panicle traits. In addition, epistatic effect plays an important role in the regulation of panicle traits.

Key words: rice(Oryza sativa L.), environment, panicle traits, epistasis interaction

中图分类号:

刘进, 姚晓云, 刘丹, 余丽琴, 李慧, 王棋, 王嘉宇, 黎毛毛. 不同生态环境下水稻穗部性状QTL鉴定[J]. 中国水稻科学, 2019, 33(2): 124-134.

Jin LIU, Xiaoyun YAO, Dan LIU, Liqin YU, Hui LI, Qi WANG, Jiayu WANG, Maomao LI. Identification of QTL for Panicle Traits under Multiple Environments in Rice(Oryza sativa L.)[J]. Chinese Journal OF Rice Science, 2019, 33(2): 124-134.

图/表 7

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性状 Trait	环境 Environment	亲本 Parent		重组自交系群体 RIL population
性状 Trait	环境 Environment	龙稻5号 Longdao 5	中优早8号 Zhongyouzao 8	平均值±标准差 βMean±SD	变幅 Range	峰度 Skewness	偏度 Kurtosis
穗长PL / cm	E₁	20.1±1.0	23.5±1.5^**	21.4±2.9	15.5~29.0	0.08	-0.63
	E₂	21.5±1.5	24.5±2.1^**	21.9±2.5	9.0~27.6	-0.75	2.99
	E₃	21.6±0.3	22.2±2.3^*	22.8±2.4	9.0~28.5	-0.98	4.91
	E₄	19.7±1.2	24.4±1.7^**	22.6±2.9	12.0~28.4	-0.61	0.55
一次枝梗数PRBN	E₁	9.0±0.6	10.2±0.4	9.8±2.5	5.6~16.8	0.28	-0.79
	E₂	13.0±0.5	13.0±0.2	11.6±2.0	5.6~17.0	-0.03	0.27
	E₃	9.8±0.5	9.2±0.2	9.6±1.8	5.4~15.0	0.45	0.33
	E₄	12.0±1.0	11.8±0.5	12.3±3.3	5.4~35.2	2.42	14.72
二次枝梗数SRBN	E₁	17.2±1.5	41.6±4.5^**	25.8±9.8	3.0~66.0	1.07	1.81
	E₂	31.0±4.0	42.0±5.0^**	29.7±10.3	7.2~57.6	0.29	-0.43
	E₃	9.2±2.0	20.4±4.5^**	13.0±7.1	1.2~51.0	1.37	4.16
	E₄	17.6±3.5	28.8±3.5^**	20.0±10.0	2.6~51.0	0.54	-0.10
每穗颖花数GN	E₁	112.0±11.2	267.8±16.3^**	145.3±48.6	46.6~308.0	0.57	0.41
	E₂	163.0±12.2	211.0±20.2^**	160.7±45.2	82.2~284.2	0.45	-0.18
	E₃	112.4±10.1	139.2±15.3^**	122.9±36.0	33.5~231.0	0.46	0.09
	E₄	119.8±10.5	158.8±15.8^**	132.7±43.2	44.2~276.2	0.40	0.06
每穗实粒数FGN	E₁	95.6±8.5	183.6±16.4^**	94.8±43.1	9.2~211.8	0.35	-0.04
	E₂	160.0±10.6	175.0±15.1^**	111.8±34.8	28.6~218.0	0.42	0.03
	E₃	88.8±9.2	71.2±12.1^*	75.5±23.1	33.5~156.4	0.46	0.82
	E₄	109.4±9.7	93.5±25.1^*	90.7±28.0	25.0~163.4	0.25	-0.17
结实率SSR / %	E₁	85.4±7.4	68.6±8.5^**	64.7±19.0	6.8~95.8	-0.96	0.54
	E₂	98.2±1.5	82.9±8.2^**	70.6±14.9	27.7~96.3	-0.52	-0.37
	E₃	79.0±7.2	51.1±12.3^**	62.4±13.0	10.5~95.2	-0.38	0.80
	E₄	91.3±5.6	58.9±6.6^**	69.8±12.4	27.7~95.5	-0.36	0.02
着粒密度	E₁	5.8±0.3	11.4±0.9^*	6.8±2.1	2.7~13.1	0.49	0.05
SD / (grain∙cm^-1)	E₂	7.6±0.5	8.6±0.7^*	7.4±2.2	3.5~13.5	0.43	-0.34
	E₃	5.2±0.2	6.3±0.4^*	5.4±1.6	1.6~10.9	0.68	0.68
	E₄	6.1±0.2	6.5±0.6^*	5.9±1.8	2.6~11.0	0.52	-0.15
千粒重TGW / g	E₁	19.62±1.52	24.85±1.23^**	23.85±4.52	12.50~35.28	0.17	-0.12
	E₂	23.62±0.92	26.82±2.01^**	24.54±3.12	16.50~28.28	0.14	-0.15
	E₃	19.42±1.32	23.87±1.25^**	22.54±2.42	16.50~26.40	0.19	-0.27
	E₄	22.62±0.63	25.83±1.51^**	24.53±4.02	15.50~30.28	0.16	-0.14

性状 Trait	环境 Environment	亲本 Parent		重组自交系群体 RIL population
性状 Trait	环境 Environment	龙稻5号 Longdao 5	中优早8号 Zhongyouzao 8	平均值±标准差 βMean±SD	变幅 Range	峰度 Skewness	偏度 Kurtosis
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	E₂	21.5±1.5	24.5±2.1^**	21.9±2.5	9.0~27.6	-0.75	2.99
	E₃	21.6±0.3	22.2±2.3^*	22.8±2.4	9.0~28.5	-0.98	4.91
	E₄	19.7±1.2	24.4±1.7^**	22.6±2.9	12.0~28.4	-0.61	0.55
一次枝梗数PRBN	E₁	9.0±0.6	10.2±0.4	9.8±2.5	5.6~16.8	0.28	-0.79
	E₂	13.0±0.5	13.0±0.2	11.6±2.0	5.6~17.0	-0.03	0.27
	E₃	9.8±0.5	9.2±0.2	9.6±1.8	5.4~15.0	0.45	0.33
	E₄	12.0±1.0	11.8±0.5	12.3±3.3	5.4~35.2	2.42	14.72
二次枝梗数SRBN	E₁	17.2±1.5	41.6±4.5^**	25.8±9.8	3.0~66.0	1.07	1.81
	E₂	31.0±4.0	42.0±5.0^**	29.7±10.3	7.2~57.6	0.29	-0.43
	E₃	9.2±2.0	20.4±4.5^**	13.0±7.1	1.2~51.0	1.37	4.16
	E₄	17.6±3.5	28.8±3.5^**	20.0±10.0	2.6~51.0	0.54	-0.10
每穗颖花数GN	E₁	112.0±11.2	267.8±16.3^**	145.3±48.6	46.6~308.0	0.57	0.41
	E₂	163.0±12.2	211.0±20.2^**	160.7±45.2	82.2~284.2	0.45	-0.18
	E₃	112.4±10.1	139.2±15.3^**	122.9±36.0	33.5~231.0	0.46	0.09
	E₄	119.8±10.5	158.8±15.8^**	132.7±43.2	44.2~276.2	0.40	0.06
每穗实粒数FGN	E₁	95.6±8.5	183.6±16.4^**	94.8±43.1	9.2~211.8	0.35	-0.04
	E₂	160.0±10.6	175.0±15.1^**	111.8±34.8	28.6~218.0	0.42	0.03
	E₃	88.8±9.2	71.2±12.1^*	75.5±23.1	33.5~156.4	0.46	0.82
	E₄	109.4±9.7	93.5±25.1^*	90.7±28.0	25.0~163.4	0.25	-0.17
结实率SSR / %	E₁	85.4±7.4	68.6±8.5^**	64.7±19.0	6.8~95.8	-0.96	0.54
	E₂	98.2±1.5	82.9±8.2^**	70.6±14.9	27.7~96.3	-0.52	-0.37
	E₃	79.0±7.2	51.1±12.3^**	62.4±13.0	10.5~95.2	-0.38	0.80
	E₄	91.3±5.6	58.9±6.6^**	69.8±12.4	27.7~95.5	-0.36	0.02
着粒密度	E₁	5.8±0.3	11.4±0.9^*	6.8±2.1	2.7~13.1	0.49	0.05
SD / (grain∙cm^-1)	E₂	7.6±0.5	8.6±0.7^*	7.4±2.2	3.5~13.5	0.43	-0.34
	E₃	5.2±0.2	6.3±0.4^*	5.4±1.6	1.6~10.9	0.68	0.68
	E₄	6.1±0.2	6.5±0.6^*	5.9±1.8	2.6~11.0	0.52	-0.15
千粒重TGW / g	E₁	19.62±1.52	24.85±1.23^**	23.85±4.52	12.50~35.28	0.17	-0.12
	E₂	23.62±0.92	26.82±2.01^**	24.54±3.12	16.50~28.28	0.14	-0.15
	E₃	19.42±1.32	23.87±1.25^**	22.54±2.42	16.50~26.40	0.19	-0.27
	E₄	22.62±0.63	25.83±1.51^**	24.53±4.02	15.50~30.28	0.16	-0.14

性状 Trait	环境Environment	PL	PRBN	SRBN	GN	FGN	SSR	SD
一次枝梗数PRBN	E₁	0.556^**
	E₂	0.161
	E₃	0.274^*
	E₄	0.345^**
二次枝梗数SRBN	E₁	0.370^**	0.662^**
	E₂	0.123	0.512^**
	E₃	0.167	0.349^**
	E₄	0.312^**	0.342^**
每穗颖花数GN	E₁	0.366^**	0.653^**	0.799^**
	E₂	0.086	0.573^**	0.927^**
	E₃	0.196^*	0.576^**	0.763^**
	E₄	0.408^**	0.472^**	0.960^**
每穗实粒数FGN	E₁	0.190^*	0.505^**	0.525^**	0.763^**
	E₂	0.048^**	0.379^**	0.654^**	0.715^**
	E₃	0.095	0.525^**	0.465^**	0.755^**
	E₄	0.272^*	0.375^**	0.694^**	0.813^**
结实率SSR	E₁	-0.098	0.657^**	-0.058	0.685^**	0.672^**
	E₂	0.046	-0.176	-0.236^*	-0.244^*	0.475^**
	E₃	-0.018	-0.022	-0.341^*	-0.249^*	0.406^**
	E₄	-0.236^*	-0.232^*	-0.398^*	-0.369^**	0.270^*
着粒密度SD	E₁	-0.045	0.462^**	0.670^**	0.904^**	0.731^**	-0.136
	E₂	-0.334^**	0.473^**	0.818^**	0.902^**	0.642^**	-0.227^*
	E₃	-0.212^*	0.480^**	0.673^**	0.903^**	0.703^**	-0.197^*
	E₄	0.029	0.384^**	0.851^**	0.915^**	0.795^**	-0.275^*
千粒重TGW	E₁	0.168	-0.088	-0.095	-0.223^*	0.098	0.126	-0.198^*
	E₂	0.230^*	-0.101	-0.161	-0.154	0.110	0.067	-0.234^*
	E₃	0.045	-0.147	-0.138	-0.216^*	-0.208^*	0.012	-0.229^*
	E₄	-0.092	-0.092	-0.176	-0.173	-0.185	0.110	0.248^*

性状 Trait	环境Environment	PL	PRBN	SRBN	GN	FGN	SSR	SD
一次枝梗数PRBN	E₁	0.556^**
	E₂	0.161
	E₃	0.274^*
	E₄	0.345^**
二次枝梗数SRBN	E₁	0.370^**	0.662^**
	E₂	0.123	0.512^**
	E₃	0.167	0.349^**
	E₄	0.312^**	0.342^**
每穗颖花数GN	E₁	0.366^**	0.653^**	0.799^**
	E₂	0.086	0.573^**	0.927^**
	E₃	0.196^*	0.576^**	0.763^**
	E₄	0.408^**	0.472^**	0.960^**
每穗实粒数FGN	E₁	0.190^*	0.505^**	0.525^**	0.763^**
	E₂	0.048^**	0.379^**	0.654^**	0.715^**
	E₃	0.095	0.525^**	0.465^**	0.755^**
	E₄	0.272^*	0.375^**	0.694^**	0.813^**
结实率SSR	E₁	-0.098	0.657^**	-0.058	0.685^**	0.672^**
	E₂	0.046	-0.176	-0.236^*	-0.244^*	0.475^**
	E₃	-0.018	-0.022	-0.341^*	-0.249^*	0.406^**
	E₄	-0.236^*	-0.232^*	-0.398^*	-0.369^**	0.270^*
着粒密度SD	E₁	-0.045	0.462^**	0.670^**	0.904^**	0.731^**	-0.136
	E₂	-0.334^**	0.473^**	0.818^**	0.902^**	0.642^**	-0.227^*
	E₃	-0.212^*	0.480^**	0.673^**	0.903^**	0.703^**	-0.197^*
	E₄	0.029	0.384^**	0.851^**	0.915^**	0.795^**	-0.275^*
千粒重TGW	E₁	0.168	-0.088	-0.095	-0.223^*	0.098	0.126	-0.198^*
	E₂	0.230^*	-0.101	-0.161	-0.154	0.110	0.067	-0.234^*
	E₃	0.045	-0.147	-0.138	-0.216^*	-0.208^*	0.012	-0.229^*
	E₄	-0.092	-0.092	-0.176	-0.173	-0.185	0.110	0.248^*

性状Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	LOD值 LOD value				贡献率PEV/%				加性效应Additive effect
性状Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄
穗长	qPL2	26.5	RM3732-RM1361	3.96				7.98				-1.11
PL	qPL3.1	29.5	RM5480-R3M10	10.82	2.53	2.54	6.06	28.06	8.41	9.90	25.68	1.31	0.83	0.86	1.33
	qPL3.2	62.5	STS3.3-RM6676	10.01			6.39	23.13			13.99	1.78			1.13
	qPL6.1	21.4	RM217-RM111	2.98				5.58				-0.75
	qPL6.2	47.4	R6M14-RM3827	3.16			3.38	8.77			7.64	-0.87			-0.80
	qPL8	111.5	RM3571-RM3754		3.97				9.77				-0.79
	qPL12	24.0	RM247-RM7003				4.16				9.85				-0.91
一次枝梗数	qPRBN1	18.5	RM6902-RM428		5.49	2.90			10.82	7.12			0.67	0.48
PRBN	qPRBN3.1	7.5	RM523-STS3.1		10.57	2.81	2.92		25.25	7.13	5.87		1.04	0.48	0.82
	qPRBN3.2	62.5	STS3.3-RM6676	4.89				9.88				0.85
	qPRBN3.3	101.5	RM3513-RM1350	3.43				7.30				-0.67
	qPRBN4	88.1	RM2441-R4M50		4.21	3.25	3.25		8.48	8.73	10.08		-0.60	-0.53	-1.06
	qPRBN6	50.4	R6M14-RM3827	13.04				40.10				-1.58
	qPRBN7	116.2	RM1306-RM248		5.34				10.94				0.67
	qPRBN8	36.5	RM5556-RM6208		2.79				5.22				-0.54
	qPRBN10	54.6	RM5620-R10M40				5.77				17.34				1.38
	qPRBN11.1	19.0	STS11.1-RM1124	4.77				8.37				0.73
	qPRBN11.2	93.0	R11M23-RM206		2.98				8.60				-0.59
二次枝梗数	qSRBN1.1	18.5	RM6902-RM428	5.54	7.69	2.92	6.53	12.64	17.12	9.05	13.65	3.51	4.29	2.17	3.74
SRBN	qSRBN1.2	81.5	STS1.1-RM306				3.30				9.81				3.42
	qSRBN2	123.5	ID4-RM6933			2.55	3.07			7.93	5.33			2.00	2.31
	qSRBN3.1	48.5	STS3.3-STS3.5	2.85		3.98		6.19		27.54		3.07		4.70
	qSRBN4.1	57.1	RM1359-R4M43	4.32	4.59		6.91	11.52	12.56		22.36	-3.44	-4.08		-4.84
	qSRBN4.2	93.1	RM2441-R4M50				3.46				5.87				-2.46
	qSRBN5	38.0	RM17954-STS5.2				3.81				9.14				3.02
	qSRBN6	57.4	R6M14-RM3827	2.71	3.62			12.16	8.58			-3.41	3.30
	qSRBN7	42.2	RM5711-STS7.1		3.53				14.40				-3.90
	qSRBN8	27.5	RM1376-RM4085				4.10				8.49				-3.29
	qSRBN10	52.6	RM467-RM6737	3.15			3.29	8.80			8.87	2.94			2.99
每穗颖花数	qGN1.1	20.5	RM428-RM323	3.84	6.67	3.74	7.29	10.43	14.86	9.24	14.17	15.93	17.58	11.04	16.41
GN	qGN1.2	83.5	STS1.1-RM306				4.91				16.09				18.85
	qGN2	122.5	ID4-RM6933			2.69				8.53				10.51
	qGN4.1	56.1	RM1359-R4M43	3.64	5.86		5.53	9.75	14.99		14.87	-15.74	-19.47		-17.00
	qGN4.2	88.1	RM2441-RM348		2.48	3.42	6.40		4.59	9.37	12.64		-9.80	-11.08	-15.42
	qGN6	31.4	RM111-STS6.2		4.68				10.73				16.29
	qGN10	54.6	RM5620-R10M40				9.27				22.91				20.70

不同生态环境下水稻穗部性状QTL鉴定

Identification of QTL for Panicle Traits under Multiple Environments in Rice(Oryza sativa L.)

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摘要/Abstract

引用本文

使用本文

图/表 7

参考文献 35

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

染色体 Chr.	主效QTL簇 Major QTL cluster	区域 Interval	性状 Trait	多效性QTL位点 Pleiotropic QTL
1	qSNP1*	β RM6902-RM259	PRBN, SRBN, GN, FGN, SD	qPRBN1, qSRBN1.1, qGN1.1, qFGN1.1, qSD1.1
3	qSNP3	STS3.3-STS3.6	PL, PRBN, SRBN, GN, SD, SSR	qPL3.2, qPRBN3.2, qSRBN3.1, qGN3.1, qSD3.1, qSSR3.1
4	qSNP4.1*	RM5688-RM1359	SRBN, GN, FGN, SSR, SD, TGW	qSRBN4.1, qGN4.1, qFGN4.1, qSSR4, qSD4.1, qTGW4
4	qSNP4.2	RM13031-RM348	PRBN, SRBN, GN, FGN, SD	qPRBN4, qSRBN4.2, qGN4.2, qFGN4.2, qSD4.2
6	qSNP6	RM217-R6M14	PL, SRBN, PRBN, GN, FGN, SD	qPL6, qSRBN6, qPRBN6, qGN6, qFGN6, qSD6
10	qSNP10	RM1375-RM6737	PRBN, SRBN, GN, FGN, SD	qPRBN10, qSRBN10, qGN10, qFGN10, qSD10

性状	染色体i	区间	染色体j	区间	LOD值	贡献率	上位性效应
Trait	Chr. i	Marker interval	Chr. j	Marker interval	LOD value	PEV/%	Epistatic effect
穗长PL	1^#	RM259-RI02500	1	RM7180-RM6703	4.98	19.18	-1.54
	1^#	RM428-RM323	10	STS10.1-RM4455	4.40	17.81	-1.03
	1^#	RM259-RI519	12	RM19-RM247	4.52	18.47	-1.27
	2	RM6933-STS2.5	12	RM7120-STS12.2	6.82	26.01	1.61
	4^#	RM5688-RM471	1	RM6547-R1M47	4.90	18.70	3.24
一次枝梗数	1^#	RM572-RM259	12	RM7120-STS12.2	5.31	8.53	0.92
PRBN	1	STS1.1-RM306	8	RM5556-RM6208	12.56	14.97	-4.29
	1	R1M30-RM3240	3	RM3513-RM1350	9.86	14.49	-4.11
	2	RM300-STS2.3	5	RM13-RM17954	4.72	11.34	0.69
	2	STS2.4-RM13603	3	RM3684-STS3.10	4.89	17.38	-0.86
	4^#	RM5688-RM471	1^#	RM3740-RM6902	4.79	13.77	-4.87
	4^#	RM5688-RM471	7	RM1132-RM8261	5.58	14.05	-4.84
	4^#	RM3648-RM1113	1	RM3412-STS1.1	4.29	9.51	-0.73
	4^#	RM3648-RM1113	12	RM19-RM247	4.62	10.32	0.88
	7	RM5711-STS7.1	10	STS10.3-RM3451	4.65	14.37	-0.97
二次枝梗数	1^#	RM259-RI519	12	STS12.2-RM1226	4.83	17.09	-4.89
SRBN	1	RM1361-RM6321	2	RM5699-RM1358	6.55	17.96	4.53
	3	RM6676-STS3.8	5	RM13-RM17954	4.90	12.03	-3.49
	4^#	RM5688-RM471	12	RM19-RM247	4.20	24.84	-4.96
	4^#	RM3648-RM1113	11	RM5599-RM167	4.84	14.12	2.79
每穗颖花数GN	1	STS1.2-RM7180	9	RM7048-STS9.3	5.91	12.39	17.90
	7	RM5711-STS7.1	11	R11M23-RM206	4.57	18.32	-19.59
	3	STS3.3-RM6676	12	STS12.2-RM1226	5.39	15.30	-16.40
每穗实粒数FGN	1	STS1.1-RM306	2	RM300-STS2.3	5.82	16.35	11.56
	4^#	R4M43-RM3288	8	RM1376-RM4085	4.25	10.42	-14.12
结实率SSR	3	RM3513-RM1350	8	RM6976-RM1345	5.98	38.09	-7.45
	3	RM3199-RM1352	6	RM3827-RM1340	5.70	16.03	-5.08
	4^#	R4M43-RM3288	1	RM1361-RM6321	7.29	23.35	-9.70
	4^#	RM5688-RM471	2	STS2.4-RM13603	4.79	17.54	-9.33
	4^#	RM5688-RM471	8	R8M33-RM6976	4.61	29.26	6.19
	7	RM5344-RM5055	10	RM1375-RM467	4.88	25.01	-6.84
	7	RM5055-RM5711	11	RM21-STS10.2	4.52	25.67	-9.84
	8	RM331-RM7285	12	RM19-RM247	4.54	26.70	7.52
着粒密度SD	4^#	RM5688-RM471	1	RM6547-R1M47	5.11	28.39	1.19
	4^#	R4M17-RM5688	2	STS2.4-RM13603	4.56	18.32	-0.96
	4^#	RM5688-RM471	7	RM1209-RM3555	4.17	16.45	-0.79

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[3]	许丹洁, 林巧霞, 李正康, 庄小倩, 凌宇, 赖美玲, 陈晓婷, 鲁国东. OsOPR10正调控水稻对稻瘟病和白叶枯病的抗性[J]. 中国水稻科学, 2024, 38(4): 364-374.
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性状 Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	LOD值 LOD value				贡献率PEV/%				加性效应Additive effect
性状 Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄
每穗实粒数	qFGN1.1	16.5	RM6902-RM428	3.19	2.91		4.42	7.51	6.88		8.96	13.28	9.13		8.44
FGN	qFGN1.2	99.5	RM306-RM2318	2.88		3.49		8.08		13.13		12.69		8.48
	qFGN1.3	140.5	RM6547-R1M47	3.93				11.08				14.55
	qFGN4.1	55.1	RM471-RM1359		5.82		2.86		18.84		7.04		-16.90	-7.67
	qFGN4.2	102.1	STS4.3-RM348			4.45	4.04			11.85	9.32			-7.98	-8.60
	qFGN5	64.0	R5M13-RM3476				2.92				21.71				13.05
	qFGN6	30.4	RM217-RM111		2.66				5.85				9.39
	qFGN10	54.6	RM5620-R10M40				8.01				22.31				13.27
结实率	qSSR2	106.5	RM13603-RM6933	3.89		2.51	3.50	15.74		9.84	11.46	-7.60		-4.22	-4.23
SSR	qSSR3.1	88.5	MM3720-MM3778		3.07				9.52				4.67
	qSSR4	47.1	RM5688-RM471		2.59				37.92				-9.97
着粒密度	qSD1.1	19.5	RM428-RM323	4.24	9.52		8.90	9.85	20.03		15.92	0.68	0.98		0.72
SD	qSD1.2	84.5	STS1.1-RM306				2.73				11.54				0.65
	qSD1.3	141.5	RM6547-R1M47	4.15				15.23				0.87
	qSD3.1	39.5	STS3.2-STS3.4			3.24				41.63				1.20
	qSD3.2	85.5	STS3.8-R3M30				3.91				8.21				-0.52
	qSD4.1	56.1	RM1359-R4M43	2.60			6.35	4.97			14.88	-0.49			-0.70
	qSD4.2	88.1	RM2441-R4M50		2.40		5.09		4.40		8.61		-0.46		-0.53
	qSD5	102.0	RM3476-RM6972				3.36				8.38				0.53
	qSD6	31.4	RM111-STS6.2		5.85				12.54				0.85
	qSD7	53.2	STS7.1-RM5481		3.65				7.05				-0.58
	qSD10	55.6	RM1375-R10M40	3.58			9.63	8.33			21.51	0.63			0.83
千粒重	qTGW3	85.5	RM3199-RM1352			2.68				8.85				1.87
TGW	qTGW4	47.1	RM5688-RM471	2.54		2.59		19.41		10.41		2.13		2.09
	qTGW5	96.0	R5M13-RM3476	7.97		2.97		38.88		18.82		-2.82		-2.62
	qTGW8	100.5	RM6976-RM1345		2.57		4.73		6.94		12.53		-1.20		-1.16
	qTGW11	93.0	RM206-RM254	2.49	2.69		2.89	7.06	7.57		10.06	-1.21	-1.25		-2.26

性状 Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	LOD值 LOD value				贡献率PEV/%				加性效应Additive effect
性状 Trait	位点 Locus	位置 Position	标记 Marker	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄	E₁	E₂	E₃	E₄
每穗实粒数	qFGN1.1	16.5	RM6902-RM428	3.19	2.91		4.42	7.51	6.88		8.96	13.28	9.13		8.44
FGN	qFGN1.2	99.5	RM306-RM2318	2.88		3.49		8.08		13.13		12.69		8.48
	qFGN1.3	140.5	RM6547-R1M47	3.93				11.08				14.55
	qFGN4.1	55.1	RM471-RM1359		5.82		2.86		18.84		7.04		-16.90	-7.67
	qFGN4.2	102.1	STS4.3-RM348			4.45	4.04			11.85	9.32			-7.98	-8.60
	qFGN5	64.0	R5M13-RM3476				2.92				21.71				13.05
	qFGN6	30.4	RM217-RM111		2.66				5.85				9.39
	qFGN10	54.6	RM5620-R10M40				8.01				22.31				13.27
结实率	qSSR2	106.5	RM13603-RM6933	3.89		2.51	3.50	15.74		9.84	11.46	-7.60		-4.22	-4.23
SSR	qSSR3.1	88.5	MM3720-MM3778		3.07				9.52				4.67
	qSSR4	47.1	RM5688-RM471		2.59				37.92				-9.97
着粒密度	qSD1.1	19.5	RM428-RM323	4.24	9.52		8.90	9.85	20.03		15.92	0.68	0.98		0.72
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	qSD4.2	88.1	RM2441-R4M50		2.40		5.09		4.40		8.61		-0.46		-0.53
	qSD5	102.0	RM3476-RM6972				3.36				8.38				0.53
	qSD6	31.4	RM111-STS6.2		5.85				12.54				0.85
	qSD7	53.2	STS7.1-RM5481		3.65				7.05				-0.58
	qSD10	55.6	RM1375-R10M40	3.58			9.63	8.33			21.51	0.63			0.83
千粒重	qTGW3	85.5	RM3199-RM1352			2.68				8.85				1.87
TGW	qTGW4	47.1	RM5688-RM471	2.54		2.59		19.41		10.41		2.13		2.09
	qTGW5	96.0	R5M13-RM3476	7.97		2.97		38.88		18.82		-2.82		-2.62
	qTGW8	100.5	RM6976-RM1345		2.57		4.73		6.94		12.53		-1.20		-1.16
	qTGW11	93.0	RM206-RM254	2.49	2.69		2.89	7.06	7.57		10.06	-1.21	-1.25		-2.26